Daniel Zobatto es miembro del Consejo Asesor del programa para América Latina del Woodrow Wilson International Center for Scholars (de los Estados Unidos de América). Fue el primer presidente del COPEC. Es asimismo miembro del Consejo Editorial de la Revista Foreign Affairs en Español y miembro del Consejo Argentino de Relaciones Internacionales (CARI). Ex miembro del Consejo Asesor Internacional del Índice de Gobernabilidad para África de la Fundación Mo Ibrahim. Ex consejero (2015), por invitación de la presidenta Michelle Bachelet, del Consejo Asesor Presidencial contra los conflictos de interés, tráfico de influencias y corrupción, Chile. Ex director Regional de IDEA Internacional para América Latina y el Caribe. Ex director ejecutivo de CAPEL. Ex director adjunto del Instituto Inter Americano de Derechos Humanos.